由于基础设施建（仅表示信息化基础）设不到位，目前中国的医疗信息化建设主要集中在大城市的大医院（中国目前有1300家左右的三甲医院，医疗信息化大多集中于此），在中小城市、特别是县、乡镇医院除了办公自动化之外，对信息化建设是有心无力，而本次医改的一个重要特点，就是将加强基层医疗，扩大基本医疗保障覆盖面，医疗信息化在这方面发挥着重要作用，本次医改使得医疗信息化的主体从此前的单个的医院转向了片区整合